特殊陶氏膜系統的啟動方式會有所差異。下面主要介紹兩級反滲透膜系統和熱消毒RO系統的啟動方式。
兩級反滲透膜系統啟動方式
當首次啟動兩級反滲透膜系統時，第一級系統須連續運行至少24小時以上，然后第一級的產水才能向第二級系統供水，否則將有可能出現第二級產水量的下降。兩級進水的pH值須根據脫鹽率調節到恰當值，對于合適的苦咸水水源，采用兩級反滲透膜系統，可使系統總產水的電導率達到<1μs/cm。
熱消毒RO系統啟動方式
新型熱消毒反滲透膜在與熱水接觸之前，須對該元件進行性能的預整定，其方法如下：
1、在低壓低產水量的條件下，采用合適的進水沖洗熱消毒反滲透膜元件。
2、在反滲透膜進水與產水間跨膜壓差小于1.7bar（25psi）最大進水壓力又小于3bar（43.5psi）低壓下，用溫度不高于45℃的溫水循環處理。
3、繼續向RO系統引入熱水，直至溫度達到80℃。
4、當水溫高于45℃時，應維持膜兩側的跨膜壓差小于1.7bar（25psi）。
5、維持上述溫度進行系統保溫60~90分鐘。
6、讓RO系統自然冷卻到45℃以下。
7、在反滲透膜進水與產水間跨膜壓差小于1.7bar（25psi）最大進水壓力又小于3bar（43.5psi）低壓下，用合格進水沖洗元件。
注意：在反滲透膜預整定期間，須使用的合格進水為不含余氯、無結垢及污堵的水質，可以使用產水，亦可以采用預處理合格產水。須在反滲透膜元件冷卻到45℃以下進行第7步的操作。
